Wetenschappelijk Medewerker AIDS Referentielaboratorium (ARL)

• Solliciteren tot 07-02-2025 23:59 (Brussels time)
• Faculteit Geneeskunde en Gezondheidswetenschappen
• Vakgroep: GE32 - Diagnostische Wetenschappen
• Tewerkstellingspercentage: 100%
• Aantal posities: 1
• Type tewerkstelling: Contract van bepaalde tijd
• Duur van de opdracht: 1 jaar
• Geboden barema: WM1 tot WM4 (masterdiploma)
• Diplomavoorwaarde: Master

OVER DE UGENT De Universiteit Gent is een wereld op zich. Meer dan 15.000 personeelsleden zijn er dagelijks aan de slag in onderwijs en onderzoek, beheer en administratie, technische en sociale voorzieningen, enz. Voor hen is de Universiteit Gent een logische keuze: het is één van de grootste, meest boeiende en toekomstgerichte werkgevers van de regio. De Universiteit Gent telt 11 faculteiten en meer dan 80 vakgroepen, die in elk van de wetenschappelijke disciplines hoogstaande en door onderzoek ondersteunde opleidingen aanbieden. JOUW OPDRACHT Je wordt aangeworven voor het werken aan het volgende wetenschappelijke project: Recente ontwikkelingen in antiretrovirale therapie (ART) hebben ervoor gezorgd dat een infectie met het humaan immunodeficiëntievirus (HIV) zich manifesteert als een chronische, controleerbare aandoening. Therapietrouw is echter vereist om de virale replicatie te onderdrukken, omdat de huidige ART-regimes het virus niet kunnen uitroeien. Karakterisatie van het viraal RNA, geëxtraheerd uit het bloedplasma, heeft aangetoond dat het virus beschikt over een uitzonderlijke genetische variabiliteit. Het genomisch landschap van HIV blijft echter grotendeels onbekend, dit omdat sequentiemethoden in het verleden zich beperkten tot de amplificatie van subgenomische regios. Hierdoor zou de ontwikkeling van een methode die in staat is om het volledig genoom van één enkele RNA-molecule (single-genomes sequencing) te sequencen zowel fundamenteel als translationeel onderzoek ten goede komen. Single-genome sequencing vereist het gebruik van een ‘limiting-dilution-proefopstelling die garandeert dat slechts één template per reactie wordt geïntroduceerd. Deze opstelling is helaas zeer tijdrovend en duur. Long-read-sequencingtechnologieën (Oxford Nanopore Technologies), die bulksequencing mogelijk maken pakken deze tekortkomingen aan, maar vereisen de introductie van unieke IDs. Binnen het Aids Referente Laboratorium streven we ernaar een betrouwbare techniek te ontwikkelen voor RNA-sequencing van RNA geëxtraheerd uit bloedplasma. Twee nieuwe strategieën zijn reeds geconceptualiseerd, maar vereisen optimalisatie van het reverse transcriptie- en PCR-proces. Deze zullen worden gevalideerd met behulp van verschillende real-time PCR-assays. De doeltreffendheid van deze strategieën worden nagegaan aan de hand van Sanger- en Oxford Nanopore Technologies sequencing. RNA-sequencing zal voornamelijk getest worden op het gebied van de gevoeligheid van de techniek. In de toekomst zijn we van plan full-length sequencing in onze routinematige diagnostische testen te implementeren om geneesmiddelresistentie-mutaties op te sporen. De full-length sequencing zal in staat zijn de ontwikkeling van nieuwe ART-klassen op te vangen. Ook andere toepassingen, gerelateerd aan fundamenteel onderzoek, zullen worden ontdekt. Studies in het kader van recombinatie en HIV-replicatie, evenals het replicatie-competente reservoir in latente CD4+ T-cellen, kunnen baat hebben bij de ontwikkeling van een full-genome RNA-sequencingtechniek. Het onderbreken van ART leidt veelal tot het herstel van de virale replicatie. Met behulp van onze nieuwe techniek streven we ernaar de cellulaire bron van deze ‘rebound-virussen te identificeren. Dit zal op zijn beurt bijdragen aan de ontwikkeling van strategieën om het replicatie-competente reservoir uit te roeien. Daarnaast zal je bij de diagnostische activiteiten van het Aids Referentie Laboratorium (ARL) betrokken worden. Je ondersteunt de routinewerking en mag je aan het volgende takenpakket verwachten:

• Je interpreteert en valideert de resultaten van verscheidene testen binnen diagnostiek en opvolging van HIV infectie. Je stelt rapporten op en verstuurt deze naar de desbetreffende aanvrager, hierbij dien je vlot gebruik te maken van de ARL database.
• Je verstrekt advies omtrent de resultaten van de verscheidene testen binnen HIV diagnostiek en bespreekt therapeutische mogelijkheden, in het kader van de genotypische resistentietest, met de aanvrager.
• Je helpt bij de ontwikkeling, aanpassing, validatie en verificatie van (nieuwe) methoden om testen binnen HIV diagnostiek verder te optimaliseren. Je neemt het initiatief om diagnostische waarnemingen te vertalen naar onderzoeksvragen.
• Je ondersteunt de kwaliteitsbeheerder in zijn/haar taken en kan bepaalde van deze taken, in opdracht van de kwaliteitsbeheerder overnemen. Je opereert hier binnen de veiligheidsvoorschriften en de kwaliteitscriteria die van toepassing zijn voor een ISO15189:2022 geaccrediteerd laboratorium.
• Je ondersteunt het epidemiologische luik en helpt bij het opstellen, nalezen en aanpassen van het jaarrapport.
• Connecties onderhouden met externe instellingen voor herstellingen en probleemoplossing van, alsook het onderhouden van connecties met verbonden AIDS Referentie Laboratoria in België.

JOUW PROFIEL

• Je hebt een diploma van Master in Geneeskunde of Biomedische Wetenschappen of Farmaceutische Wetenschappen
• Je hebt ervaring met het verwerken van humane bloedstalen.
• Je bent een expert in reverse transcriptie- en PCR, en hierop gebaseerde technieken.
• Je bent bedreven in verscheiden sequencingtechnieken: Sanger en Oxford nanopre sequencing.
• Je beschikt over een uitgebreide kennis van de virale replicatie cyclus van HIV die je in staat stelt om RNA sequencing data te interpreteren.
• Je beschikt over een uitgebreide virologische kennis over HIV die je in staat stelt om testresultaten te interpreteren en een advies te verlenen aan de aanvrager van de test.
• Je beschikt over de moleculaire achtergrondkennis die je in staat stelt om de moleculaire en serologische technieken te analyseren.
• Je hebt kennis van de veiligheidsvoorschriften in een L2 en hebt notie van de werkwijze binnen ISO15189:2022 norm.
• Je bent vertrouwd met de R programmeertaal om de gegenereerde data eenduidig weer te geven
• Je hebt uitstekende vaardigheden in het gebruik van MS Excel, Word, PowerPoint, GraphPad Prism, Bioedit en Smartgene IDNS.
• Je bent communicatief, integer, creatief, kwaliteitsbewust en een echte teamspeler.
• Je hebt een goede beheersing van zowel Nederlands als Engels en communiceert vlot, zowel mondeling als schriftelijk.

ONS AANBOD

• Wij bieden je een contract van bepaalde tijd voor een periode van 1 jaar.
• De indiensttreding kan ten vroegste vanaf 1/03/2025.
• De verloning gebeurt volgens barema WM1 tot WM4. Meer informatie over onze salarisschalen.
• Verder kan elk UGent-personeelslid rekenen op een aantal voordelen, zoals een breed opleidings- en vormingsaanbod, 36 vakantiedagen (op jaarbasis voor een voltijdse betrekking), een fietsvergoeding, ecocheques enz. Een volledig overzicht van onze personeelsvoordelen.

INTERESSE? Solliciteren kan alleen online via e-recruitment tot de uiterste inschrijvingsdatum (zie bovenaan). We aanvaarden geen laattijdige sollicitaties of sollicitaties die niet via de online toepassing worden bezorgd. Volgende documenten dien je toe te voegen aan je sollicitatie:

• In het veld ‘Cv: je cv
• In het veld ‘Motivatiebrief: je motivatiebrief
• In het veld ‘Diploma: een kopie van het vereiste diploma (indien reeds in je bezit)
• In het veld “Andere documenten”: een referentiebrief, studieresultaten,

Let op: elk veld heeft een beperking van maximum 10 MB. De UGent voert een gelijkekansen- en diversiteitsbeleid en moedigt dan ook iedereen aan om te solliciteren. MEER INFORMATIE Voor meer informatie in verband met deze vacature kunt u contact opnemen met prof. E. Padalko (elizaveta.padalko@UGent.be, +32 (0)9/3322108). Let op: stuur je sollicitatie niet via e-mail door, maar solliciteer online. Heb je vragen over online solliciteren? Lees de FAQ of contacteer ons via selecties@ugent.be of 09 264 34 36